바이오니아

바이오니아는 생명과학 연구용 시약·장비, 분자진단, RNA 신약·화장품, 프로바이오틱스 등 네 개 축으로 구성된 유전자 기술 기반 바이오헬스케어 기업이다.

창업 초기 PCR·프라이머 등 분자생물학 소모품 국산화로 시작한 연구용 시약·장비 사업이 뿌리이며, 이를 토대로 자체 분자진단 플랫폼 ExiStation 시리즈와 실시간 PCR 장비 ExiCycler, 각종 감염병 진단키트를 생산하는 분자진단 부문으로 확장했다.

그러나 실제 연결 손익을 좌우하는 것은 자회사 에이스바이옴이 판매하는 체지방 감소 기능성 유산균 '비에날씬(BNR17)'이다.

관련 분석에 따르면 바이오니아는 유전자·분자진단 기반 기업이지만 실제 손익은 에이스바이옴의 비에날씬이 좌우하며, 2025년에는 프로바이오틱스 부문 매출이 매출 3,070억원(전체의 93%)·영업이익 347억원으로 연결 실적을 견인한 반면 본업인 연구·분자진단 부문은 매출 360억원에 영업손실 217억원을 낸 것으로 파악된다.

매출 10% 이상을 차지하는 상위 고객 4곳이 모두 홈쇼핑·유통업체(현대홈쇼핑, GS리테일, CJ ENM, 홈앤쇼핑)로 집계되며, 이들 합산 매출이 전체의 절반을 넘어서는 등 비에날씬·홈쇼핑 채널 의존도가 높다.

분자진단 부문은 유럽 체외진단의료기기 규정(CE-IVDR)에서 HIV-1에 이어 B형·C형간염바이러스(HBV·HCV) 정량진단키트까지 최고위험군인 Class D 인증을 획득해 유럽 병원·국제 공공조달 시장 공략 기반을 갖췄다.

RNA 신약·화장품 축에서는 짧은간섭RNA(siRNA) 기반 탈모완화 화장품 '코스메르나'와 RNAi 신약 파이프라인 개발을 병행하고 있으며, 이 부문은 정부과제·라이선스 매출로 소규모 이익을 내는 구조다.

코스메르나는 국내에서는 식품의약품안전처의 반복된 반려와 행정소송 패소로 기능성화장품 인허가가 막혀 일반화장품·해외 우선 출시로 전략을 선회했으며, 경쟁구도상 분자진단에서는 씨젠·SD바이오센서 등 국내 진단기업들과, 프로바이오틱스에서는 다수의 홈쇼핑 유산균 브랜드들과 경쟁한다.

바이오니아의 연결 매출액은 2022년 2,184억원에서 2023년 2,632억원, 2024년 2,940억원을 거쳐 2025년 3,301억원으로 4년 연속 증가했다.

영업이익은 부침이 컸는데, 2022년 115억원(영업이익률 5.3%) 흑자에서 2023년 7.9억원(0.3%)으로 급격히 축소됐고 2024년에는 -134억원(-4.6%) 영업손실로 전환했다가 2025년 152억원(4.6%)으로 다시 흑자전환했다.

다만 지배주주 순이익은 2022년 120.8억원 흑자를 기록한 이후 2023년 -105.9억원, 2024년 -205.8억원, 2025년에도 -28.1억원으로 4년 연속 적자를 이어갔다.

연결 순이익(17.1억원)과 지배주주 순이익(-28.1억원)의 격차는 비지배지분(에이스바이옴 소수주주) 몫이 이익의 상당 부분을 가져간 데 따른 것으로 풀이된다.

최근 4개 분기(2025년 3분기~2026년 2분기)로 보면 분기별 매출은 880억원→798억원→818억원→961억원 순으로 등락했고, 영업이익도 28.8억원→27.0억원→-5.3억원(적자)→11.8억원으로 재차 흑자·적자를 오갔다.

이 구간 지배주주 순손실은 매 분기 지속돼 합계 약 -66.7억원에 달했으며, 2026년 1분기에는 -31.5억원으로 손실 폭이 일시 확대되기도 했다.

2026년 2분기에는 매출이 분기 기준 역대 최대인 961억원을 기록하며 영업이익도 다시 흑자로 돌아섰는데, 회사는 신약 연구개발비를 전분기보다 오히려 늘리면서도 매출 성장에 따른 규모의 효과로 손익이 개선됐다고 설명했다.

이 같은 흐름은 프로바이오틱스 부문의 견조한 매출 성장과 분자진단 부문의 구조적 적자가 동시에 진행되는 회사의 손익 구조를 보여준다.

분자진단 시장은 코로나19 특수가 소멸한 이후 감염병 상시진단·바이럴로드 검사 등 상시 수요 중심으로 재편되는 국면이다.

글로벌 바이럴로드 검사시장은 2025년 기준 약 62억 달러 규모로 추산되며 HIV 검사가 전체의 42.8%를 차지하고, HCV 검사시장은 2030년까지 연평균 7.4% 성장할 것으로 전망된다.

이 시장에서 바이오니아는 상온 유통이 가능한 동결건조 PCR 시약과 전자동 분자진단 시스템을 앞세워 콜드체인 인프라가 부족한 아프리카·동남아시아·남미 등 신흥시장 공급 경쟁력을 강조하고 있다.

국내 분자진단 업계에는 씨젠, SD바이오센서 등 코로나19 특수를 거친 경쟁사들이 다수 자리하고 있어 포스트 코로나 국면에서 공통적으로 매출 정상화·신규 시장 개척 과제에 직면해 있다.

건강기능식품(프로바이오틱스) 시장은 성숙 단계에 접어들었지만 체지방·다이어트 컨셉의 유산균 카테고리는 홈쇼핑을 중심으로 여전히 활발한 신제품 경쟁이 벌어지고 있다.

RNA 기반 화장품·치료제 시장은 아직 초기 단계로, siRNA 등 신물질의 화장품·의약품 경계 획정을 둘러싼 규제 불확실성이 한국을 비롯한 여러 국가에서 진행형 이슈다.

국내 탈모증상완화 화장품 시장은 2021년 3,383억원에서 2025년 4,990억원까지 성장할 것으로 전망된 바 있어, 규제 리스크가 해소될 경우 잠재 시장 자체는 확대되는 흐름이다.

회사는 분자진단 부문에서 2026년 중 차세대 플랫폼(ExiStation FA 96, IRON-qPCR 등) 매출 개시를 목표로 제시했고, 이를 바탕으로 2027년 진단 부문 흑자전환을 지향하는 것으로 파악된다.

유럽에서는 HIV-1에 이어 HBV·HCV 정량진단키트까지 CE-IVDR 최고위험군(Class D) 인증을 획득했고, 4월 ESCMID 2026 학회 참가를 통해 유럽 주요 오피니언 리더 대상 마케팅을 본격화했다.

RNA 신약 파이프라인은 임상 1b상이 진행 중이며, 2026년 2분기에는 신약 연구개발비를 전분기보다 늘리는 등 투자를 지속하고 있다.

신규 협업으로는 오가노이드사이언스와 혈액유래 세포 기반 모낭 오가노이드 탈모 치료제를 공동개발하는 업무협약을 체결해 RNA 기술과 오가노이드 기술을 결합한 차세대 파이프라인 확장을 모색하고 있다.

코스메르나는 국내 기능성화장품 재도전이 2026년에도 반려·이의신청 기각으로 이어지면서, 회사는 국내에서는 일반화장품으로 전환 출시하고 이미 인증받은 유럽·영국·일본·싱가포르 등 해외 시장 위주로 사업을 확장하는 투 트랙 전략을 유지하고 있다.

프로바이오틱스 부문은 비에날씬의 홈쇼핑 유통 확대와 해외 판촉 행사를 통해 매출 성장을 이어가겠다는 방침이다. 다만 진단 부문의 대규모 인증·임상 투자가 지속되는 만큼, 연결 손익의 분기별 변동성은 프로바이오틱스 부문의 성장 속도와 진단 부문 투자 집행 시점에 따라 계속될 가능성이 있다.