토모큐브

토모큐브는 2015년 설립된 광학·인공지능 기반 3D 세포 이미징 기업으로, 살아있는 세포와 오가노이드를 염색이나 절편화 없이 실시간 3차원으로 분석하는 홀로토모그래피(HT) 기술을 핵심 역량으로 삼고 있다.

회사의 이 기술은 빛의 회절 분석을 기반으로 한 3차원 구조 역연산 방식으로, 디지털 마이크로미러 소자(DMD)를 이용해 광원을 고정한 상태에서도 대상물의 형태를 정확히 구현하는 것이 특징이다.

제품 라인업은 초기 1세대 HT-1H·HT-2H에서 2세대 HT-X1, 이보다 저가형인 HT-X1 mini, 고가형 HT-X1 Plus로 세분화됐고, 2026년에는 측정 성능을 한층 높인 차세대 플래그십 HT-X1 Max 출시가 예정돼 있다.

고객군은 대학·병원 등 연구기관 중심의 바이오 연구용 장비 판매에서 출발해, 스위스 연방공대·존스홉킨스 등 세계 각국 기관 및 글로벌 제약사와의 공동연구로 확장돼 왔다.

최근에는 반도체·디스플레이 정밀 검사용 산업 계측 모듈(비바이오) 사업으로 영역을 넓히고 있으며, 2024년 이엘피와 산업용 모듈 공급 계약을 체결한 바 있다.

리딩투자증권에 따르면 토모큐브의 홀로토모그래피 기술은 기존 하이브리드 본딩 공정의 측정 시간을 2분에서 1초로 단축시키는 효과가 있는 것으로 소개됐다. 여기에 AI 기반 표현형 분석 소프트웨어를 구독형(SaaS) 모델로 결합해, 장비 판매에 더해 반복적 매출 기반을 마련하려는 전략을 취하고 있다.

대리점 없이 직접판매 방식을 유지해 브랜드 가치와 수익성을 동시에 관리한다는 점도 특징이다.

경쟁 구도 측면에서는 1세대 레이저 방식 경쟁사 대비 해상도·안정성에서 기술적 우위를 주장하고 있으며, 사외이사로 파크시스템스 대표이사가 참여하고 있어 시장에서는 반도체 계측 업체인 파크시스템스와 유사한 성격의 기업으로 비교되기도 한다.

토모큐브의 연간 매출은 2023년 37.5억원에서 2024년 59.4억원, 2025년 113.1억원으로 매년 큰 폭으로 늘었지만, 같은 기간 영업손실은 67.3억원, 87.8억원, 55.7억원으로 이어지며 적자 기조에서 벗어나지 못했다.

다만 2025년 영업손실률(영업이익률 -49.3%)은 2024년(-147.8%)과 2023년(-179.7%)에 비해 눈에 띄게 개선된 수치다.

분기 흐름을 보면 2025년 2분기 매출 31.4억원·영업손실 11.3억원, 3분기 매출 25.2억원·영업손실 18.3억원으로 오히려 손실이 확대됐다가, 4분기에는 매출이 49.9억원으로 급증하며 영업이익 4.0억원, 지배주주순이익 6.4억원을 기록해 상장 이후 처음으로 분기 흑자로 전환했다.

그러나 2026년 1분기 매출이 27.5억원으로 다시 줄어들면서 영업손실이 18.7억원으로 확대돼, 회사가 콥데이에서 언급한 대로 4분기 매출 집중·1분기 둔화라는 계절성이 재현됐다.

2026년 2분기에는 매출이 49.6억원으로 4분기 수준을 회복했고 영업손실은 5.9억원, 지배주주순손실은 2.0억원으로 손실 폭이 크게 좁혀졌다.

이에 따라 최근 네 개 분기(2025년 3분기~2026년 2분기) 합산 지배주주순손실은 24.5억원으로, 분기별 변동성은 크지만 연간 단위로는 손실 규모가 점진적으로 줄어드는 흐름이 나타난다.

재무상태 측면에서는 순차입이 거의 없는 저부채 구조가 유지되고 있으며, 부채비율은 2023년 11.7%에서 2024년 3.9%로 낮아졌다가 2025년 7.0%로 다소 높아졌다.

반면 영업활동현금흐름은 2023년 -59.3억원, 2024년 -65.4억원, 2025년 -67.5억원으로 매출 성장에도 현금 유출 규모가 오히려 소폭 커지고 있어, 성장에 따른 투자·운영 비용 지출이 계속되고 있음을 보여준다.

자기자본은 2023년 177.1억원에서 상장 자금 유입 등의 영향으로 2024년 419.9억원으로 크게 늘었으나, 누적 손실 반영으로 2025년에는 387.9억원으로 소폭 줄었다.

토모큐브가 속한 홀로토모그래피 기반 3D 세포 이미징 시장은 동물실험 대체 트렌드와 오가노이드 산업화라는 두 축의 구조적 변화를 배경으로 성장하고 있다.

미국 식품의약국(FDA)이 추진하는 새로운 접근법(NAM, New Approach Methodologies) 중심의 비임상 시험 패러다임 전환은 오가노이드 등 3차원 인간 모델 수요 증가로 이어지고 있으며, 비임상시험대행기관(CRO) 글로벌 1위 업체인 Charles River Laboratories도 이러한 흐름에 대응하는 전략을 이어가고 있는 것으로 언급된다.

증권사 추정에 따르면 토모큐브가 겨냥하는 전체 시장 규모는 국내·미국·유럽·중국 등을 합산해 약 7.6조원 수준으로 제시된 바 있으며, 이 가운데 미국과 유럽 비중이 크다.

경쟁 구도에서는 초기 레이저 기반 1세대 홀로토모그래피 장비를 공급하는 해외 업체와 비교되며, 토모큐브는 LED 다중 광원 방식과 측정 높이 개선을 앞세워 기술적 차별화를 주장하고 있다.

대신증권은 두꺼운 3D 시료를 손상 없이 정량 분석할 수 있는 장비가 현재로서는 토모큐브가 유일하다고 평가하며, 대형 오가노이드 분석 분야에서의 독보적 지위를 투자 포인트로 꼽았다.

산업용(비바이오) 계측 시장에서는 반도체 하이브리드 본딩, 디스플레이·유리기판 검사 등에서 비파괴 3D 내부 검사 수요가 커지고 있으나, 이 영역은 토모큐브에게 상대적으로 신규 진입 분야로 레퍼런스 축적이 진행 중인 단계다.

전체적으로 산업은 초기 성장 국면에 있어 표준화·인허가·레퍼런스 확보 속도가 개별사의 점유율 확대를 좌우할 가능성이 크다.

회사는 2026년 매출 가이던스로 164억원 이상을 제시하며 손익분기점(BEP) 달성을 목표로 내세우고 있다.

구완성 토모큐브 최고재무책임자(CFO)는 지난 3월 말 콥데이에서 이 같은 목표를 밝히며, 2024년 59억원·2025년 113억원으로 이어진 매출 성장세를 근거로 가이던스 달성 가능성을 자신했다.

회사는 올해 신규 플래그십 모델 HT-X1 Max 출시를 계획하고 있는데, 글로벌 제약사와의 테스트 과정에서 출시가 다소 지연됐으나 연내 시판 일정에는 변동이 없다고 설명했다.

HT-X1 Max는 최대 해상도 124nm, 측정 높이 최대 500㎛로 기존 2세대 제품 대비 성능이 2배 이상 개선된 것으로 소개된다.

산업용(비바이오) 부문에서는 반도체 웨이퍼 분야를 포함해 파트너사와의 협업이 진행 중이며, 회사는 올해 비바이오 부문에서만 50억원 이상의 매출을 기대한다고 밝힌 바 있다.

일부 증권사는 2026년 3분기 초고가 장비 관련 데이터 공개, 4분기 HT-X1 Max 출시와 산업용 품질 테스트 진입 등을 향후 모멘텀으로 짚었으나, 이는 애널리스트의 전망이며 확정된 일정은 아니다.

다만 2026년 1분기 실적이 다시 적자로 돌아선 데서 보듯, 연간 가이던스 달성 여부는 하반기 산업용·바이오 매출이 얼마나 뒷받침되는지에 달려 있다.

회사 스스로도 매출에 계절성이 있어 4분기에 집중되고 1분기는 상대적으로 부진한 경향이 있다고 설명하고 있어, 분기 실적의 굴곡을 감안한 연간 단위 평가가 필요하다는 입장이다.