PER·EPS·PBR·BPS는 최근 4개 분기(2025Q3~2026Q2) 기준 자체 산출 · 배당수익률은 주당 0원 기준 · 시세 2026-10-02 장마감
대학 ERP 수주잔고 증가와 2026년 1~2분기 연속 영업흑자 전환이 확인됐지만, 순이익 변동성과 부채비율 급등 등 재무구조 부담이 함께 나타나고 있다.
2025년 매출은 272.6억원으로 전년 대비 26.1% 늘었으나 영업손실 23.7억원으로 4년 만에 두 번째 적자를 기록했다.
2026년 1분기(영업이익 2.4억원)와 2분기(0.2억원) 연속 영업흑자를 냈지만, 2분기 지배주주순이익은 -2.4억원으로 오히려 적자를 기록해 일회성 손익 변동성이 크다.
2026년 1분기 수주잔고는 236억원으로 전년 동기 대비 22.9% 늘며 3년 연속 증가세를 이어갔다.
미국 자회사 사이버엠디케어(CMD)는 디지털 헬스케어 플랫폼 'NOVA'로 메디케어 어드밴티지 시장 공략을 확대하며 텍사스 보험사와 서비스 운영 계약을 체결했다.
2025년 부채비율은 130.9%로 전년 28.5%에서 급등했고, 비지배주주지분은 -11.6억원으로 마이너스 전환했다.
토마토시스템은 2000년 설립된 IT 솔루션 기업으로, 대학 ERP(전사적 자원관리), 웹 표준 기반 UI/UX 개발 플랫폼, 미국 디지털 헬스케어 사업을 3대 축으로 영위한다.
대학 ERP 제품 '엑스캠퍼스(eXCampus)'는 국내 400여개 대학 중 150여개 이상을 고객사로 확보했으며, 재도입률이 75%에 달해 반복 매출 기반이 안정적이라는 평가를 받는다.
UI/UX 개발 플랫폼 '엑스빌더6(eXBuilder6)'는 여기에 생성형 AI를 결합한 '엑스빌더6 아이젠(eXBuilder6 AIGen)'으로 진화하며 금융·공공·제조 분야로 고객군을 넓히고 있다.
2026년 1분기 기준 매출 구성은 솔루션 매출이 62.2%, 유지보수 및 기술 매출이 37.8%를 차지했다. 최근에는 전북대·원광대·고려대·서울대 등 대학 정보화 사업뿐 아니라 메리츠증권·흥국화재 등 금융권, 대우건설 등 건설업계로 UI/UX 플랫폼 공급을 확대하고 있다.
미국에서는 현지법인 사이버엠디케어(CyberMDCare, CMD)를 통해 디지털 헬스케어 플랫폼 'NOVA'를 개발, 메디케어·메디케어 어드밴티지 시장을 겨냥한 원격 환자 모니터링과 연례건강검진(AWV) 서비스를 제공한다.
2026년 3월에는 이강찬 대표를 영입해 조길주 대표와 함께 각자대표 체제로 전환했으며, 조 대표는 중장기 성장전략과 신사업, 이 대표는 영업 및 주력 솔루션 사업 운영을 각각 총괄한다. 창업주인 이상돈 의장을 비롯한 핵심 경영진 다수가 LG CNS 출신이라는 공통 배경을 갖고 있다.
| 분기 | 매출액 | 영업이익 | 영업이익률 |
|---|---|---|---|
| 2025Q2 | 59억 | -8억 | −12.8% |
| 2025Q3 | 70억 | -8억 | −11.0% |
| 2025Q4 | 88억 | -45,278,365원 | −0.5% |
| 2026Q1 | 83억 | 2억 | 2.9% |
| 2026Q2 | 84억 | 21,406,709원 | 0.3% |
| 연도 | 매출액 | 영업이익 | 지배주주 순이익 | 영업이익률 | ROE | 부채비율 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2022 | 271억 | 75억 | 46억 | 27.5% | 36.0% | 36.1% |
| 2023 | 266억 | 28억 | 33억 | 10.6% | 11.0% | 26.0% |
| 2024 | 216억 | -34억 | -16억 | −15.8% | −5.7% | 28.5% |
| 2025 | 273억 | -24억 | -20억 | −8.7% | −7.7% | 130.9% |
연결 기준(자회사 실적을 합친 재무제표) · DART 공시 확정치 · 순이익은 지배주주 기준 · 데이터 2026-09-05
연간 실적을 보면 2022년 매출 270.9억원, 영업이익 74.6억원(영업이익률 27.5%)으로 고수익 구간을 기록한 뒤, 2023년에는 매출 265.7억원, 영업이익 28.2억원(영업이익률 10.6%)으로 이익률이 축소됐다.
2024년에는 매출이 216.2억원으로 급감하며 영업손실 34.1억원(영업이익률 -15.8%)을 기록해 상장 후 첫 대규모 적자를 냈다.
2025년에는 매출이 272.6억원으로 전년 대비 26.1% 회복했으나 영업손실은 23.7억원(영업이익률 -8.7%)으로 적자가 이어졌고, 지배주주순이익도 -20.0억원에 머물렀다. 다만 손실 규모는 2024년 대비 완만하게 줄어드는 흐름을 보였다.
분기별로는 2025년 2분기(매출 58.6억원, 영업손실 7.5억원)와 3분기(매출 69.7억원, 영업손실 7.7억원)까지 적자가 이어졌으나, 4분기(매출 88.5억원, 영업손실 0.45억원)에는 손실이 거의 손익분기점까지 좁혀졌다.
2026년 1분기에는 매출 82.8억원, 영업이익 2.4억원으로 분기 기준 영업흑자로 전환했고, 지배주주순이익도 14.5억원의 큰 폭 순이익을 기록했다.
2분기에는 매출 84.2억원, 영업이익 0.2억원으로 흑자 기조를 이어갔지만, 지배주주순이익은 -2.4억원으로 다시 적자를 나타내 영업이익과 순이익 간의 괴리가 발생했다.
최근 4개 분기(2025년 3분기~2026년 2분기) 누적 지배주주순이익은 약 2.5억원으로 소폭이지만 플러스권에 진입한 점이 특징이다.
국내 대학 ERP 시장은 학령인구 감소에 대응한 대학들의 행정 자동화 및 노후 시스템 교체 수요, 정부의 '글로컬대학 30' 등 지역대학 육성 정책과 맞물려 구조적 수요가 형성되고 있다는 분석이 나온다.
독립리서치 아리스는 2026년 6월 발간한 보고서에서 정부의 대형 교육정책과 함께 대학 ERP 사업이 성장 국면에 진입했다고 평가했다. UI/UX 개발 플랫폼 시장에서는 생성형 AI를 결합한 저코드·자동생성형 툴의 경쟁이 확대되고 있으며, 회사는 엑스빌더6 아이젠을 통해 이 흐름에 대응하고 있다.
공공·금융권의 디지털 전환(DX) 수요 확대도 UI/UX 플랫폼과 시스템 통합 사업의 성장 동력으로 꼽힌다.
미국 디지털 헬스케어 시장은 CMS의 'V28 HCC' 모델 도입에 따라 환자 임상 데이터를 정밀하게 관리해야 하는 가치 기반 의료로 전환되는 국면에 있으며, 이는 메디케어 어드밴티지 보험사들의 디지털 플랫폼 수요를 늘리는 요인으로 지목된다.
다만 이 시장은 대형 헬스테크 기업들과의 경쟁이 상존하는 영역으로, 신규 진입 기업이 규모의 경제를 확보하기까지는 시간과 투자가 필요하다.
국내 IT서비스 업종 내에서 토마토시스템은 대학 특화 ERP라는 니치 시장에서 선도적 지위를 갖고 있으나, 전체 매출 규모는 코스닥 소형주 수준에 머물러 있어 대형 SI 업체 대비 사업 다각화 폭이 제한적이다.
회사는 하반기 엑스빌더6 아이젠을 중심으로 AI 솔루션 사업 확대에 나선다는 계획을 밝혔다.
2026년 1분기 기준 수주잔고 상위 계약은 원광대(56.9억원), 서울대(30.0억원), 대우건설(25.8억원), 전북대(12.1억원), 고려대(11.9억원) 순으로, 다수 프로젝트가 구축 진행 단계에 따라 순차적으로 매출에 반영되는 구조여서 회사 측은 실적 가시성이 높다고 설명한다.
미국에서는 CMD가 텍사스 소재 보험사 메드케어 파트너스와 보험 포털 및 디지털 헬스케어 플랫폼 통합 서비스 운영 계약을 체결했으며, NOVA 플랫폼 핵심 기술에 대해 미국 특허청(USPTO)에 본출원 3건과 가출원 20여 건을 진행하는 등 지식재산 확보에도 속도를 내고 있다.
회사 측은 공공과 금융권을 중심으로 디지털 전환 수요가 확대되면서 관련 수주가 증가하고 있으며, 대학 ERP 경쟁력을 기반으로 제조 분야까지 사업 영역을 확장하고 있다고 밝혔다.
다만 이러한 신규 수주와 신사업 투자가 실제 이익 개선으로 얼마나 안정적으로 연결될지는 향후 분기 실적에서 추가로 확인이 필요하다. 2026년 1~2분기 연속 영업흑자는 긍정적 신호지만, 분기별 순이익 변동성이 커 아직 이익의 질적 안정성이 충분히 검증되지 않은 상태다.
현재 주가수준은 최근 몇 년간 회사가 적자와 흑자를 오간 실적 기준에서 형성되고 있어, 과거 이익이 안정적으로 나던 시기의 거래 배수와 직접 비교하기는 조심스럽다.
순자산 대비로는 완만한 프리미엄이 존재하는 구간으로 파악되며, 이는 대학 ERP 슈퍼사이클 및 미국 헬스케어 신사업에 대한 시장의 성장 기대가 일부 반영된 결과로 해석될 수 있다. 회사는 최근 수년간 현금배당을 실시하지 않아, 주주환원보다는 신사업 투자와 재무구조 안정에 자금이 우선 배분되는 모습이다.
2026년 들어 분기 영업이익이 흑자로 전환했지만 순이익 변동성이 커, 이익 안정성이 밸류에이션에 어떻게 반영될지는 향후 분기 실적 누적을 통해 판단할 필요가 있다.
종합적으로 현재 밸류에이션은 이익 회복의 지속성에 대한 시장의 기대와 실제 실적 간의 간극을 어떻게 좁혀가는지에 따라 평가가 달라질 수 있는 구간으로 보인다.
PER·EPS·PBR·BPS 모두 자체 산출(네이버·토스와 동일 방식) · 배당은 DART 공시 주당현금배당금(보완:KRX) ÷ 현재가 · 기준 2026-09-05
독립리서치 아리스는 2026년 6월 보고서에서 정부의 대형 교육정책과 함께 대학 ERP 사업이 성장 국면에 진입했다고 평가했다. 회사의 2026년 1분기 수주잔고는 236억원으로 전년 동기 대비 22.9% 증가하며 3년 연속 성장세를 이어갔다.
국내 400여개 대학 중 150여개 이상을 고객사로 확보하고 재도입률이 75%에 달해 반복 매출 기반이 넓다. 학령인구 감소에 대응한 노후 시스템 교체 수요와 지역대학 육성 정책이 추가 수주로 이어질 가능성이 거론된다.
2026년 1분기와 2분기 연속으로 영업이익이 흑자를 기록하며, 2024~2025년 이어진 영업손실 흐름에서 벗어나는 모습을 보였다. 상반기 매출은 166.99억원으로 전년 동기 대비 46% 증가해 40%대의 견조한 외형 성장률을 나타냈다.
회사 측은 대학 차세대 정보화 사업과 공공·금융권 프로젝트의 안정적 진행, UI/UX 플랫폼 사업 확대를 실적 개선의 배경으로 제시했다. 4분기 연속 손실 규모가 줄어든 뒤 흑자로 전환한 흐름은 비용 구조 개선의 신호로 해석될 수 있다.
미국 자회사 CMD는 디지털 헬스케어 플랫폼 'NOVA'를 통해 메디케어 어드밴티지 시장을 겨냥한 사업을 확대하고 있다. 2026년 6월 텍사스 소재 보험사 메드케어 파트너스와 보험 포털 및 헬스케어 플랫폼 통합 서비스 운영 계약을 체결했다.
NOVA 핵심 기술에 대해 미국 특허청에 본출원 3건과 가출원 20여 건을 진행해 지식재산 확보에도 나서고 있다. CMS의 'V28 HCC' 모델 도입에 따른 가치 기반 의료 전환이 신규 수요를 창출할 것으로 회사 측은 기대하고 있다.
2026년 2분기에는 영업이익이 흑자였음에도 지배주주순이익은 -2.4억원으로 적자를 기록해 영업외 손익의 변동성이 크다는 점이 드러났다. 반대로 1분기에는 영업이익 2.4억원 대비 순이익이 14.5억원으로 훨씬 큰 규모를 보여, 분기 간 이익의 질이 일관되지 않는 모습이다.
이런 변동성은 투자자가 분기별 숫자만으로 실적 개선의 지속성을 판단하기 어렵게 만든다. 향후 몇 개 분기에 걸쳐 영업이익과 순이익의 방향이 일치하는지 확인이 필요하다.
2025년 부채비율은 130.9%로 2024년 28.5%에서 크게 뛰었고, 부채총액도 78억원에서 324억원으로 급증했다. 같은 기간 비지배주주지분은 -11.6억원으로 마이너스 전환해 연결 대상 자회사(미국 법인 포함 가능성)에서 손실이 누적되고 있음을 시사한다.
지배주주 자기자본은 2024년 277.8억원에서 2025년 258.9억원으로 줄어들며 자본 감소가 동반됐다. 이 같은 재무구조 변화는 향후 신사업 투자를 지속할 자금 여력과도 연결되는 지표다.
회사는 2022년 높은 영업이익률(27.5%)을 기록한 이후 2023년, 2024년 연속으로 마진이 축소되며 2024년에는 큰 적자로 전환한 이력이 있다. 2025년에도 매출은 회복됐지만 영업손실이 이어졌고, 2026년 상반기에야 겨우 흑자로 돌아섰다.
이런 등락은 특정 대형 프로젝트의 매출 인식 시점과 일회성 비용에 좌우되는 사업 구조에서 기인하는 것으로 보인다. 과거 사이클을 감안하면 최근의 흑자 전환이 안정적으로 지속될지는 추가 분기를 통해 검증이 필요하다.
분기별 영업이익과 순이익 간 괴리가 크고, 과거 4년간 연간 영업손익이 흑자와 적자를 반복해 온 만큼 향후 실적의 예측 가능성이 제한적이다. 특정 대형 프로젝트의 매출 인식 시점에 따라 분기 실적이 크게 출렁일 수 있다. 투자자는 단일 분기 실적보다 여러 분기에 걸친 추세를 함께 살펴볼 필요가 있다.
2025년 부채비율이 130.9%로 전년 대비 급등했고, 비지배주주지분이 마이너스로 전환한 점은 자회사 차원의 손실 누적 가능성을 시사한다. 신사업(미국 헬스케어) 투자가 지속되는 동안 추가적인 자금 조달이나 재무구조 부담이 발생할 가능성을 배제할 수 없다. 재무구조 개선 여부는 향후 분기 및 연간 공시를 통해 지속적으로 확인할 필요가 있다.
미국 디지털 헬스케어 사업은 CMS의 규제 모델 변화와 보험사 협상에 의존하는 구조로, 계약 체결 속도와 규모가 기대에 못 미칠 가능성이 있다. 환율 변동, 미국 의료 규제 변화, 현지 경쟁사와의 경쟁도 사업 확장에 영향을 줄 수 있는 변수다. 신규 특허 출원이 실제 매출 성장으로 이어지기까지는 시간이 필요할 수 있다.
2026년 3분기 실적 공시를 통해 영업이익 흑자 기조가 3개 분기 연속 이어지는지, 순이익 변동성이 완화되는지 확인이 필요하다.
CMD의 추가 보험사·헬스플랜 계약 체결 여부와 NOVA 플랫폼 매출 반영 속도를 확인할 필요가 있다.
신규 대형 대학 ERP 계약 체결 여부와 기존 프로젝트(원광대·서울대 등)의 매출 인식 진행률을 살펴볼 필요가 있다.
2026년 연간 부채비율과 비지배주주지분 추이를 통해 재무구조 개선 여부를 확인해야 한다.
토마토시스템은 2026년 상반기 두 분기 연속 영업흑자를 내며 2024~2025년의 적자 국면에서 벗어나는 신호를 보였지만, 분기별 순이익은 영업이익과 반대 방향으로 움직이는 등 이익의 질적 안정성은 아직 검증 단계에 있다.
대학 ERP 사업은 수주잔고 3년 연속 증가와 높은 재도입률을 바탕으로 반복 매출 기반을 갖추고 있으며, 정부의 대형 교육정책이 우호적 환경으로 거론된다. 동시에 미국 디지털 헬스케어 신사업이 CMD를 통해 메디케어 어드밴티지 시장 공략을 확대하며 중장기 성장 축을 추가하고 있다.
다만 2025년 부채비율이 130.9%로 급등하고 비지배주주지분이 마이너스로 전환한 점은 신사업 투자 과정에서의 재무 부담을 보여준다. 종합하면 회사는 외형 회복과 흑자 전환의 초기 신호를 확보했으나, 이익의 지속성과 재무구조 안정화라는 두 가지 과제를 동시에 해결해야 하는 국면에 있다. 향후 분기별 실적과 연간 재무구조 지표를 함께 추적하는 것이 판단에 도움이 될 것으로 보인다.
리포트 작성 2026-09-05 · 데이터 기준 2026-09-04
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