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3billion · 바이오·제약 · 코스닥 · 리포트 2026-09-05
쓰리빌리언은 AI 기반 희귀질환 유전체 진단을 핵심 사업으로 매출 성장과 영업손실률 개선을 이어가는 가운데, 미국 시장 진출과 신약개발 확장이 다음 국면의 핵심 변수로 부각되고 있다.
쓰리빌리언은 2016년 마크로젠에서 스핀오프해 설립된 AI 기반 희귀질환 유전체 진단 기업으로, 2024년 11월 코스닥에 상장했다. 핵심 사업은 전장엑솜분석(WES)과 전장유전체분석(WGS)을 기반으로 한 'Full Service' 희귀질환 진단으로, 자체 AI 변이 해석 모델 '3ASC 2.0'을 통해 8,000여 종의 희귀질환을 단일 검사로 진단할 수 있는 기술력을 보유하고 있다. 진단 서비스 외에도 특정 질환 진단, 데이터 기반 진단, SaaS형 구독 서비스 'GEBRA(제브라)' 등으로 매출원을 다각화하고 있으며, 지난 2월 가족 단위 유전자 검사 '패밀리 인사이트'를 출시해 해외를 중심으로 매출을 내기 시작했다. 지난 6월에는 건강한 신생아를 대상으로 한 유전체 기반 신생아 선별검사 '3B-NEO'를 해외 출시하고 필리핀 정부 주관 신생아 선별검사 사업 수행기관으로 선정됐다. 회사는 희귀질환 진단 과정에서 축적한 환자 유전체·임상 데이터를 활용해 AI 신약개발 사업에도 나서고 있으며, 표적 발굴 플랫폼 'SAGE'와 후보물질 설계 플랫폼 'MIN-T'를 통해 전임상 단계 라이선스아웃을 목표로 하고 있다. 2026년 상반기 기준 해외 매출은 전체의 약 69%를 차지했으며, 전 세계 75개국 이상에서 매출이 발생하고 있다. 미국 시장에서는 진단 시장 1위 업체인 진디엑스(GeneDx)와 경쟁 구도를 형성하고 있으며, 회사는 이보다 낮은 검사 단가를 앞세워 진입을 준비하고 있다.
쓰리빌리언의 연결 매출액은 2023년 27억 3천만원에서 2024년 57억 7천만원, 2025년 117억 1천만원으로 3년 연속 두 배 이상 증가했다. 같은 기간 영업손실은 2023년 83억 5천만원에서 2024년 74억 2천만원, 2025년 58억 9천만원으로 축소됐고, 매출 대비 영업손실률(영업이익률)도 -305.9%, -128.5%, -50.3%로 꾸준히 개선됐다. 지배주주 순손실은 2023년 50억 9천만원, 2024년 65억 7천만원으로 확대됐다가 2025년 54억 1천만원으로 줄어드는 흐름을 보였다. 분기별로 보면 2025년 2분기 매출 25억 9천만원·영업손실 15억 9천만원, 3분기 매출 32억 3천만원·영업손실 12억 7천만원으로 매출 증가와 함께 손실 규모가 줄어드는 추세가 이어졌다. 2026년 1분기에는 매출 33억 6천만원, 영업손실 16억 6천만원을 기록했고, 2분기에는 매출 37억 9천만원으로 늘었으나 영업손실도 16억 7천만원으로 소폭 확대됐다. 다만 2026년 2분기 지배주주 순이익은 67억 2천만원의 흑자를 기록했는데, 이는 5월 발행한 전환사채(CB)와 전환우선주(CPS)의 공정가치 변동에 따른 비현금성 평가이익이 반영된 결과로, 회사는 이것이 "실제 현금 유입이나 본업의 영업흑자 전환과는 무관하다"고 설명했다. 연결 기준 영업활동현금흐름은 2023년 -48억 7천만원, 2024년 -41억원, 2025년 -35억 6천만원으로 매년 마이너스를 기록했으나 그 규모는 점차 줄어드는 흐름을 보였다. 연결 부채비율은 2023년 93.9%에서 2024년 6.9%로 크게 낮아졌다가 2025년 25.7%로 다시 높아졌는데, 이는 CB·CPS 발행에 따른 부채 항목 증가가 반영된 결과로 해석된다.
글로벌 희귀질환 진단 시장은 기존 패널 검사에서 전장엑솜분석(WES)·전장유전체분석(WGS) 기반 검사로 빠르게 전환되고 있으며, 시장조사기관 리서치앤마켓은 관련 시장 규모가 2024년 352억 3000만달러에서 2025년 382억 2000만달러로 늘어날 것이라고 추산했다. 회사에 따르면 미국이 글로벌 희귀질환 진단 시장의 48%를 차지하는 것으로 추산되며, 미국 내 WES·WGS 진단 단가는 한국 대비 5~6배 수준으로 형성돼 있어 매출 레버리지 효과가 클 것으로 업계는 보고 있다. 미국 시장에서는 진디엑스(GeneDx)가 20년 이상의 사업 경험과 영업망을 갖춘 선두 업체로 꼽히는 가운데, 신한투자증권은 쓰리빌리언의 검사 단가가 진디엑스 평균판매단가(ASP) 2500달러에 비해 낮은 990달러인 점을 감안하면 가격경쟁력이 있을 것이라고 분석한 바 있다. 신생아 진단, 신속 희귀질환 진단 등 인접 시장도 빠르게 성장하는 것으로 평가되며, 관련 시장 규모는 각각 신생아 진단 시장(130조원), 신속 희귀질환 진단 시장(65조원) 수준으로 추산된다. 다만 이 같은 시장 규모·경쟁력 추산치는 개별 증권사·회사 IR 자료 기준이라는 점에서 해석에 유의가 필요하다. 경쟁 구도상 전 세계적으로 유전체 기반 희귀질환 진단을 전문으로 하는 기업 수는 제한적인 것으로 알려져 있으며, 회사는 자체 축적한 다인종 환자 데이터와 AI 변이 해석 기술을 핵심 차별화 요소로 제시하고 있다.
| 주가 | ₩4,705 |
|---|---|
| 시가총액 | 1,497억원 |
| ROE | -22.9% |
회사는 2025년 10월 미국 텍사스에 100% 자회사 '쓰리빌리언US'를 설립하고 300만 달러를 출자했으며, CAP·CLIA·CDPH 등 미국 유전자검사 관련 핵심 인증을 확보해 현지 영업 기반을 마련했다. 2026년 상반기 CLIA 랩 구축을 마무리하고 하반기부터 미국 매출이 본격화될 것이라는 전망이 증권가에서 제기된 바 있으나, 실제 매출 반영 규모와 시점은 향후 분기 공시를 통해 확인이 필요하다. 신생아 선별검사 '3B-NEO'는 필리핀 정부 주관 사업 수행기관으로 선정돼 현지 신생아를 대상으로 임상적 활용 가능성을 검증하고 있으며, 회사는 관련 매출이 하반기부터 순차적으로 반영될 것으로 예상하고 있다고 밝혔다. 회사는 올해 CB 125억원과 CPS 175억원을 발행해 총 300억원을 조달했으며, 이를 글로벌 진단사업 확대와 신규 검사 서비스 개발, AI 신약개발 연구개발 등에 투입할 계획이라고 설명했다. 신약개발 부문에서는 표적 발굴 플랫폼 'SAGE'와 후보물질 설계 플랫폼 'MIN-T'를 활용해 전임상 단계 후보물질을 발굴하고 있으며, 글로벌 제약사와의 공동 개발 및 기술이전(L/O) 성과 가시화를 목표로 사업개발을 진행 중인 것으로 파악된다. 금창원 대표는 올해 기술이전 등 사업적 성과를 최대한 빨리 만들어 내는 것이 목표라고 밝힌 바 있다. 다만 이들 신규 사업의 매출 기여 시점과 규모는 아직 확정되지 않은 만큼, 향후 분기 실적과 공시를 통해 구체적인 진행 상황을 확인해야 한다.
쓰리빌리언은 여전히 순손실을 기록하고 있어 이익 기준 밸류에이션 지표를 적용하기 어려운 구간에 있으며, 주가는 순자산가치 대비 상당한 프리미엄이 반영된 상태에서 거래되고 있다. 회사는 배당을 실시하지 않고 있어 배당수익률 측면에서는 업종 평균을 밑도는 편이다. 다년간 흐름을 보면 매출 성장과 함께 영업손실률이 꾸준히 개선되는 등 손익 구조가 적자에서 점진적인 이익 회복 방향으로 이동하고 있으나, 2026년 2분기의 순이익 흑자 전환은 본업의 수익성 개선이 아닌 금융상품 공정가치 평가에 따른 일시적 요인이라는 점을 감안할 필요가 있다. 상장 이후 주가는 미국 시장 진출 기대와 흑자전환 전망이 부각될 때 단기적으로 강세를 보이는 경향이 있었던 것으로 관찰되며, 이러한 이벤트 드리븐 성격은 향후에도 이어질 가능성이 있다. 투자자는 매출 성장세와 영업손실 축소 속도, 그리고 비현금성 평가손익을 제외한 본업 현금흐름의 변화를 함께 살펴볼 필요가 있다.
2026년 상반기 해외 매출은 전체의 약 69%를 차지하며 전년 동기 대비 59% 증가했고, 가족 단위 유전자 검사 '패밀리 인사이트'와 신생아 선별검사 '3B-NEO'가 새로운 매출원으로 추가되고 있다. 필리핀 정부 주관 신생아 선별검사 사업 수행기관 선정은 진단 서비스의 적용 범위를 희귀질환 환자에서 예방 중심 검사로 확장하는 사례다. 다양한 국가·검사 유형으로 매출원이 분산되면 특정 지역·서비스에 대한 의존도를 낮출 수 있다.
쓰리빌리언은 텍사스에 100% 자회사를 설립하고 CAP·CLIA·CDPH 인증을 모두 확보해 미국 내 영업을 위한 규제 요건을 충족했다. 미국은 유전체 진단 단가가 높고 보험 수가 적용이 활발한 시장으로 꼽히며, 진입에 성공할 경우 매출 레버리지가 클 수 있다는 분석이 나온다. 낮은 검사 단가를 앞세운 가격 경쟁력도 후발주자로서의 진입 전략으로 제시되고 있다.
영업손실률은 2023년 -305.9%에서 2025년 -50.3%로 크게 낮아졌으며, 2026년 상반기에도 매출 대비 영업손실률이 전년 동기보다 개선된 것으로 나타났다. 매출 성장 속도가 비용 증가 속도를 웃돌면서 손실 규모가 완화되는 흐름이 여러 분기 동안 이어지고 있다. 이러한 흐름이 지속될 경우 향후 분기별 손익분기점 도달 가능성에 대한 시장의 관심이 이어질 것으로 보인다.
영업활동현금흐름은 2023년부터 2025년까지 매년 마이너스를 기록했으며, 그 규모가 줄어들고 있음에도 여전히 순유출 상태다. 회사는 CB·CPS 발행을 통해 외부 자금을 조달해 이를 충당하고 있는데, 이는 향후 지분 희석이나 재무 부담으로 이어질 가능성이 있다. 미국 진출에 따른 초기 투자 비용이 추가로 발생할 경우 현금 소진 속도가 다시 빨라질 수 있다.
2026년 2분기 순이익 흑자는 회사가 직접 밝힌 대로 전환사채·전환우선주의 공정가치 변동에 따른 비현금성 평가이익에 기인한 것으로, 본업의 수익성 개선을 나타내는 지표가 아니다. 같은 분기 영업손실은 오히려 직전 분기보다 소폭 확대됐다. 향후 이러한 금융상품의 공정가치가 반대 방향으로 움직일 경우 순손익이 다시 크게 출렁일 가능성도 배제할 수 없다.
미국 희귀질환 진단 시장에는 20년 이상의 사업 경험과 영업망을 갖춘 진디엑스(GeneDx) 등 기존 강자가 자리하고 있어, 신규 진입자로서 시장 점유율 확보에 시간이 걸릴 수 있다. 현지 랩 구축, 인력 충원, 인증 유지 등에 따른 고정비 증가도 불가피하다. 보험 수가 적용 여부와 협상 과정에서의 불확실성도 매출화 시점에 영향을 줄 수 있는 변수다.
쓰리빌리언은 2023년부터 2025년까지 매출이 매년 두 배 이상 성장하고 영업손실률이 -305.9%에서 -50.3%로 개선되는 등 외형 성장과 손익 구조 개선을 동시에 보여주고 있다. 2026년 2분기의 순이익 흑자 전환은 전환사채·전환우선주 공정가치 평가이익에 따른 비현금성 요인이며, 회사도 이를 본업의 수익성 개선과는 무관하다고 밝힌 만큼 해석에 주의가 필요하다. 미국 텍사스 법인 설립과 핵심 인증 확보, 필리핀 신생아 선별검사 사업 선정 등은 중장기 성장 동력으로 거론되지만, 실제 매출화 시점과 규모는 아직 공시로 확정되지 않았다. 영업활동현금흐름은 매년 마이너스를 이어가고 있어 외부 자금 조달에 대한 의존도가 이어지는 구조다. 부채비율은 CB·CPS 발행 영향으로 2025년 25.7%로 다시 높아졌다. 향후 관전 포인트는 미국 매출의 실제 반영 시점, 신사업의 매출 기여도, 그리고 비현금성 항목을 제외한 본업 현금흐름의 개선 여부다.
English version
3Billion continues to post revenue growth and a narrowing operating loss ratio in its core AI-based rare disease genomic diagnostics business, with US market entry and drug discovery expansion emerging as the key variables for the next phase.
3Billion is an AI-based rare disease genomic diagnostics company that spun off from Macrogen in 2016 and listed on KOSDAQ in November 2024. Its core business is 'Full Service' rare disease diagnosis based on Whole Exome Sequencing (WES) and Whole Genome Sequencing (WGS), using its proprietary AI variant interpretation model '3ASC 2.0' to diagnose over 8,000 rare diseases in a single test. Beyond diagnostics, the company diversifies revenue through specific-disease testing, data-based diagnostics, and its SaaS subscription platform 'GEBRA', and it launched the family-based genetic test 'Family Insight' in February, which has begun generating overseas revenue. In June, the company launched its genomic newborn screening service '3B-NEO' overseas and was selected as an implementing agency for the Philippine government's newborn screening program. Leveraging patient genomic and clinical data accumulated through its diagnostic business, the company has also entered AI-driven drug discovery, operating a target discovery platform called 'SAGE' and a candidate design platform called 'MIN-T' aimed at preclinical-stage licensing deals. As of the first half of 2026, overseas revenue accounted for about 69% of the total, with sales generated in more than 75 countries. In the US market, the company competes with market leader GeneDx and is preparing entry with lower per-test pricing.
3Billion's consolidated revenue rose from KRW 2.73bn in 2023 to KRW 5.77bn in 2024 and KRW 11.71bn in 2025, more than doubling for three consecutive years. Over the same period, the operating loss narrowed from KRW 8.35bn in 2023 to KRW 7.42bn in 2024 and KRW 5.89bn in 2025, with the operating margin steadily improving from -305.9% to -128.5% to -50.3%. Net loss attributable to owners widened from KRW 5.09bn in 2023 to KRW 6.57bn in 2024 before narrowing to KRW 5.41bn in 2025. By quarter, revenue of KRW 2.59bn with an operating loss of KRW 1.59bn in Q2 2025 was followed by revenue of KRW 3.23bn and an operating loss of KRW 1.27bn in Q3 2025, continuing a trend of rising revenue alongside shrinking losses. In Q1 2026, revenue reached KRW 3.36bn with an operating loss of KRW 1.66bn, and in Q2 2026 revenue grew to KRW 3.79bn while the operating loss widened slightly to KRW 1.67bn. Notably, net income attributable to owners turned positive at KRW 6.72bn in Q2 2026, driven by non-cash fair-value gains on convertible bonds and preferred shares issued in May, which the company stated was not driven by an operating profit turnaround. Consolidated operating cash flow remained negative every year — KRW -4.87bn in 2023, KRW -4.10bn in 2024, and KRW -3.56bn in 2025 — though the shortfall gradually narrowed. The consolidated debt ratio fell sharply from 93.9% in 2023 to 6.9% in 2024 before rising again to 25.7% in 2025, reflecting the liability impact of the CB and CPS issuances.
The global rare disease diagnostics market is rapidly shifting from panel-based testing toward WES- and WGS-based testing, with market researcher Research and Markets estimating that the global rare disease diagnostics market would grow from $35.23bn in 2024 to $38.22bn in 2025. According to the company, the US is estimated to account for 48% of the global rare disease diagnostics market, and industry observers note that US WES/WGS testing prices are 5-6 times higher than in Korea, implying significant revenue leverage. GeneDx is regarded as the leading player in the US market with over two decades of operating history and sales infrastructure, and Shinhan Investment & Securities has analyzed that the company's pricing at $990 versus GeneDx's average selling price of $2,500 could offer a price advantage. Adjacent markets such as newborn screening and rapid rare disease diagnosis are also seen as expanding quickly, with estimated market sizes of KRW 130 trillion for newborn screening and KRW 65 trillion for rapid rare disease diagnosis. These market-size and competitiveness figures originate from brokerage or company IR estimates and should be interpreted with appropriate caution. The number of companies globally specializing in genomics-based rare disease diagnosis is understood to be limited, and the company positions its accumulated multi-ethnic patient data and AI variant interpretation technology as its core differentiator.
| Price | ₩4,705 |
|---|---|
| Market cap | ₩0.15T |
| ROE | -22.9% |
The company established its wholly owned US subsidiary '3Billion US' in Texas in October 2025 with an investment of $3 million, and secured key US genetic testing accreditations including CAP, CLIA, and CDPH to build a local operating base. Brokerages have suggested that CLIA lab setup would be completed in the first half of 2026 with US revenue ramping in the second half, though the actual timing and scale of revenue recognition require confirmation through future quarterly disclosures. The newborn screening service '3B-NEO' was selected for the Philippine government's screening program, validating its clinical utility on local newborns, and the company stated that related revenue is expected to be recognized progressively starting in the second half. The company raised a total of KRW 30bn this year through KRW 12.5bn in convertible bonds and KRW 17.5bn in convertible preferred shares, stating plans to deploy the funds toward global diagnostics expansion, new testing service development, and AI drug discovery R&D. In drug discovery, the company is using its target discovery platform 'SAGE' and candidate design platform 'MIN-T' to identify preclinical-stage candidates, with business development underway aimed at joint development and licensing deals with global pharmaceutical companies. CEO Kum Chang-won has stated that this year's goal is to generate business achievements such as licensing deals as quickly as possible. However, since the timing and scale of revenue contribution from these new businesses remain unconfirmed, concrete progress should be tracked through upcoming quarterly results and disclosures.
3Billion continues to post net losses, placing it in a range where earnings-based valuation metrics are difficult to apply, and its shares trade at a notable premium to net asset value. The company does not pay dividends, so its dividend yield trails the sector average. Over a multi-year view, the loss structure has moved gradually from deficit toward income recovery as revenue growth has been accompanied by a steadily improving operating loss ratio, but it should be noted that the net income turnaround in Q2 2026 stemmed from a temporary fair-value gain on financial instruments rather than an improvement in core profitability. Since listing, the share price has tended to show short-term strength around news of US market entry and profitability turnaround expectations, and this event-driven pattern may continue going forward. Investors may wish to track revenue growth, the pace of operating loss reduction, and changes in core cash flow excluding non-cash valuation gains or losses.
In the first half of 2026, overseas revenue accounted for about 69% of total revenue, up 59% year-on-year, with the family genetic testing product 'Family Insight' and the newborn screening test '3B-NEO' being added as new revenue sources. Being selected as the operating institution for the Philippine government's newborn screening program is an example of expanding the scope of diagnostic services from rare disease patients to prevention-focused testing. Diversifying revenue sources across various countries and test types can reduce dependence on any specific region or service.
3billion has established a wholly-owned subsidiary in Texas and secured all CAP, CLIA, and CDPH certifications, meeting the regulatory requirements for operating in the U.S. The U.S. is considered a market with high genomic diagnostic unit prices and active insurance reimbursement, and analysts suggest that revenue leverage could be significant if entry succeeds. Price competitiveness backed by low test unit costs is also being presented as a market entry strategy as a late mover.
The operating loss ratio sharply improved from -305.9% in 2023 to -50.3% in 2025, and the operating loss ratio relative to revenue in the first half of 2026 also improved compared to the same period last year. Over several quarters, the trend of narrowing losses has continued as revenue growth has outpaced cost increases. If this trend continues, market interest in the potential timing of quarterly breakeven is expected to persist.
Operating cash flow has been negative every year from 2023 to 2025, and although the scale is decreasing, it remains in a net outflow state. The company has been covering this through external funding via CB and CPS issuances, which could lead to future equity dilution or financial burden. If additional initial investment costs arise from U.S. market entry, the pace of cash depletion could accelerate again.
As the company itself has stated, the net profit surplus in Q2 2026 stems from non-cash valuation gains due to changes in the fair value of convertible bonds and convertible preferred stock, and is not an indicator of improved profitability in the core business. In the same quarter, the operating loss actually widened slightly compared to the previous quarter. The possibility that net profit/loss could swing significantly again in the future if the fair value of these financial instruments moves in the opposite direction cannot be ruled out.
The U.S. rare disease diagnostics market is occupied by established players such as GeneDx, which has over 20 years of business experience and sales networks, meaning it could take time for a new entrant to gain market share. Increased fixed costs from establishing local labs, hiring personnel, and maintaining certifications are also inevitable. Uncertainty regarding insurance reimbursement eligibility and the negotiation process is also a variable that could affect the timing of revenue realization.
3Billion has demonstrated both top-line growth and improving profit-and-loss structure, with revenue more than doubling each year from 2023 to 2025 and the operating loss ratio improving from -305.9% to -50.3%. The net income turnaround in Q2 2026 stemmed from a non-cash fair-value gain on convertible bonds and preferred shares, and the company itself has stated this is unrelated to core profitability, warranting careful interpretation. The establishment of the Texas subsidiary with key accreditations and selection for the Philippine newborn screening program are cited as mid-to-long-term growth drivers, but the actual timing and scale of revenue contribution have not yet been confirmed through disclosures. Operating cash flow has remained negative every year, reflecting continued reliance on external financing. The debt ratio rose again to 25.7% in 2025 due to the impact of CB and CPS issuances. Key points to watch going forward include the actual timing of US revenue recognition, the revenue contribution of new businesses, and improvement in core cash flow excluding non-cash items.
본 리포트는 공시(DART)·시장 데이터(KRX) 기반의 AI 생성 정보 자료이며 투자 권유가 아닙니다.
This report is AI-generated from public disclosures (DART) and market data (KRX) for informational purposes only. It is not investment advice.
데이터 기준 2026-09-22 · KOSAI
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